Sinus pilonidalis günümüzde, koksigeal bölgenin subkutan dokusunda akut veya kronik inflamasyon ile karakterize, ailesel yatkınlığı olan edinsel bir hastalık olarak kabul edilmektedir. İnsidansı dünya genelinde artmaktadır. Erkek cinsiyet iki kattan fazla oranda etkilenmektedir. Puberteden yaşamın 4. on yılına kadar olan hastalık zirvesi, eğitim ve mesleki günlük yaşamdaki kısıtlamalar nedeniyle yüksek sosyoekonomik önemi açıklamaktadır.
Güncel bilgilere göre nedeni, saç kesimi sırasında başın arka bölgesinde oluşan kesilmiş kıl parçalarıdır; bunlar arka ter oluğu boyunca intergluteal oluğa düşer, dikleşir ve ardından cilde saplanır. Derin bir anal oluk ve nateslerin yoğurma hareketleri, düşen keskin kenarlı kesilmiş kılların cilde girmesini kolaylaştırır. Pilonidal sinüs yuvasında bulunan kılların çoğu 5-10 mm uzunluğunda ve bir veya iki taraftan kesilmiştir. Pilonidal sinüsü olan hastalarda belirgin biçimde daha sert kıl saplarına sahip kıllar bulunur. Kılın girişi, pulların yönelimine bağlıdır. Artık kendiliğinden iyileşmeyen bir yabancı cisim granülomu gelişir. Bu asemptomatik olabilir veya enfekte olarak klinik olarak belirgin hâle gelebilir. Travma bir pilonidal sinüs oluşturmasa da, bir çarpma travması tekil asemptomatik bir kanalı ödematöz biçimde kapatabilir ve böylece birikinti ve ağrı ya da sekresyonun eşlik ettiği bir ilk olaya yol açabilir.
Yoğun kıllanma pilonidal sinüs hastalığını teşvik ediyor gibi görünmektedir; teoriye göre yoğun intergluteal kıllanma düşen kesilmiş kılları daha uzun süre yerinde tutar ve uzayan maruziyet süresi daha fazla saplanmaya olanak tanır. Bu nedenle düzenli banyo ve duş içeren iyi bir vücut hijyeni, anal oluktan keskin kesilmiş kıl parçalarının düzenli olarak uzaklaştırılmasını sağladığından, daha düşük bir hastalık sıklığıyla ilişkili görünmektedir.